血栓形成常繼發於：①肝硬變或肝外壓迫引起門靜脈充血和門靜脈血流郁滯;②腹腔內化膿性感染，如壞疽性闌尾炎、潰瘍性結腸炎、絞窄性疝等;③某些血液異常，如真 性紅細胞增多症，口服避孕藥造成的高凝狀態;④外傷或手術造成的損傷，如腸系膜血腫、脾切除、右半結腸切除等。約1/4的病人無明顯誘因，稱為原發性腸系 膜靜脈血栓形成。靜脈血栓形成後，可向近遠端繼續蔓延。當受累腸曲的靜脈迴流完全受阻時，腸管充血水腫，漿膜下先點狀出血，後擴散成片。腸壁和腸系膜增厚、水腫。繼之，腸曲發生出血性梗死，呈暗紫色。大量血性液體從腸壁和腸系膜滲出至腸腔和腹腔。靜脈急性閉塞尚可反射性引起內臟動脈的痙攣和血栓形成，加 速腸壞死的過程。最後同樣導致低血容量、感染中毒性休克。
本病有原發性和繼發性兩種，但以繼發性為多見。常伴有高凝狀態(如真性紅細胞增多症和癌症)、腸系膜上靜脈損傷(外傷、手術、放療、門-腔靜脈分流術後)、腹腔感染和長期服用避孕藥等。近半數患者有周圍靜脈血栓性炎症病史，故可能是血栓性靜脈炎的一種特殊類型(內臟型)。
常有門靜脈血流郁滯、高凝、或血管損傷的誘因。起病較緩慢。表現為腹部不適、便秘或腹瀉。數日或數周后，隨著血栓蔓延擴大，靜脈血液迴流受阻，影響腸麴生 機時，突然發生劇烈腹痛，持續性嘔吐，腹瀉和血水樣便比動脈栓塞更為多見。體檢時可見腹脹、腹部壓痛、反跳痛和腹肌緊張。腸鳴音減弱或消失。腹腔穿刺可抽到血性液體。常有發熱和白細胞計數、紅細胞壓積增高。腹部X線平片可顯示受累小腸擴張充氣，伴有氣液平面。透視時腸蠕動消失。
體檢時可見腹脹、腹部壓痛、反跳痛和腹肌緊張。腸鳴音減弱或消失。腹腔穿刺可抽到血性液體。常有發熱和白細胞計數、紅細胞壓積增高。腹部X線平片可顯示受累小腸擴張充氣，伴有氣液平面。透視時腸蠕動消失。
門靜脈高壓(portal hypertension)是一組由門靜脈壓力持久增高引起的症候群。絕大多數病人由肝硬化引起，少數病人繼發於門靜脈主幹或肝靜脈梗阻以及一些原因不明的因素。當門靜脈血不能順利通過肝臟迴流入下腔靜脈就會引起門靜脈壓力增高。表現為門-體靜脈間交通支開放，大量門靜脈血在未進入肝臟前就直接經交通支進入體循環，從而出現腹壁和食管靜脈擴張;脾臟腫大和脾功能亢進;肝功能失代償和腹水等。
門靜脈積氣(portal venous gas，PVG)是指由於各種原因導致氣體在門靜脈及其肝內門靜脈分支異常積聚形成的影像學徵象，通常是通過腹部X線片診斷。常見於新生兒壞死性小腸結腸炎。新生兒壞死小腸結腸炎是以腹脹、嘔吐和便血為主要臨床表現，腸壁囊樣積氣為X線特徵的一種嚴重疾病。
硬化時，門靜脈壓力增高，超過200毫米水柱時，正常消化器官和脾的回心血流經肝受阻，導致門靜脈系統許多部位和腔靜脈之間建立門-體側支循環。
常有門靜脈血流郁滯、高凝、或血管損傷的誘因。起病較緩慢。表現為腹部不適、便秘或腹瀉。數日或數周后，隨著血栓蔓延擴大，靜脈血液迴流受阻，影響腸麴生 機時，突然發生劇烈腹痛，持續性嘔吐，腹瀉和血水樣便比動脈栓塞更為多見。體檢時可見腹脹、腹部壓痛、反跳痛和腹肌緊張。腸鳴音減弱或消失。腹腔穿刺可抽到血性液體。常有發熱和白細胞計數、紅細胞壓積增高。腹部X線平片可顯示受累小腸擴張充氣，伴有氣液平面。透視時腸蠕動消失。
體檢時可見腹脹、腹部壓痛、反跳痛和腹肌緊張。腸鳴音減弱或消失。腹腔穿刺可抽到血性液體。常有發熱和白細胞計數、紅細胞壓積增高。腹部X線平片可顯示受累小腸擴張充氣，伴有氣液平面。透視時腸蠕動消失。
術前診斷尚有困難，血管造影價值不大。主要對引起血栓的疾病的預防和治療。常因急性腸梗塞合并腹膜炎在剖腹探查中確診。可行血栓切除術，如有腸壞死者，需同時行腸切除。